Almanya’daki Erfurt Üniversitesi’nin Din Araştırmaları kürsüsünde daimi öğretim üyesi, Max Weber Kültür ve Sosyal Bilimler İleri Araştırma Merkezi’nin ve Beşeri Bilimler İleri Araştırma Merkezi’ndeki “Kent Kültürü ve Din: Karşılıklı Biçimlendirmeler” araştırma grubunun eş yöneticisidir. Eski Akdeniz’e ve onu açıklamaya uygun kavramlara odaklanan araştırmaları, kent bağlamında dinsel değişim ve din ekonomisi konularına doğru genişlemiştir. Kitapları Almanca ve İngilizce başta olmak üzere çeşitli dillerde yayımlanan Rüpke’nin Türkçeye çevrilen ilk monografı Pantheon’dur. İngilizce monografları şunlardır: Religion of the Romans (2007), The Roman Calendar form Numa to Constantine (2011), Religion in Republican Rome (2012); From Jupiter to Christ (2014), Religious Deviances in the Roman World (2016), On Roman Religion (2016), Pantheon (2018), Peace and War in Ancient Rome (2019), Urban Religion (2020), Religion and Its History (2021), Priests in ancient Rome (2025). Rüpke ayrıca A Companion to Roman Religion (2007), A Companion to the Archaeology of Religion in the Ancient World (2015, Rubina Raja ile birlikte) kitaplarının ve dinde bireysellik, yaşanan antik din ve dinsel hoşgörü konularındaki çeşitli kitapların editörlüğünü yapmıştır.